在2002年的中国民航业重组中，东航一度被认为受益颇丰。当时，东航以国有资产划拨方式接收了西北航空、云南航空的资产和负债，借此获得了陕西、云南等收益良好的航线。但值得注意的是，当时西北航空和云南航空的资产负债率都超过了100%，并购完成后，东航凭空多出了上百亿元的债务，从此背上了巨额的债务包袱。其中，仅当时已连续亏损5年的西北航空就为东航带来了约80亿元的债务。

　　与此同时，国航“拿下”了西南航空，一家1999年利润率高达25.1%的航空公司。南航则联合了北方航空和新疆航空，2002年底，北方航空亏损6.7亿元、新疆航空亏损1.9亿元，但相对于资不抵债的西北航空和云南航空，国航与南航分得的地区性航空公司无疑资产更为优良。

　　而重组给东航带来的不仅是沉重的财务包袱，“重组以后，东航和被它兼并的公司磨合存在问题，双方产生了很多矛盾。而且由于和东航原本所拥有的机型不一致，还造成维修保养费用高企，这些都是不利的地方，也给东航带来了很大负担。”郑庆平分析说。

　　内部管理存在问题

　　相对于国航和南航，东航在各项运营指标上均存在不同程度的差距。