（二）投资行业分布的差异。长期以来，台湾的创业投资机构以高新技术产业为主要投资对象。以2010年为例，投资金额占总投资额比例为据，排名前五位的分别是光电（31.41%）、电子工业（13.07%）、半导体（11.8%）、其他制造业（10.90%）、生物科技与制药（8.73%）,这五项共占总投资额的75%以上。近年来大陆创投对高新技术产业的投资持续走低，但投资重点仍主要聚集于高新技术产业。2010年高新技术产业投资金额所占比例为52.4%，传统产业为47.6%。2010年投资金额最为集中的五个行业分别是传统制造业（10.1%）、新材料工业（9.3%）、新能源和高效节能技术（8.3%）、金融服务（7.8%）、消费产品和服务（7.1%），这五项共占总投资的43%左右。显然，大陆受到扩大内需等政策的影响，风险投资者倾向于大陆“反周期”性的传统行业，比如基础设施、餐饮、零售、医疗等关系民生的行业和低碳、节能、环保等新兴产业。因此，海峡两岸创投在行业的选择上重点各有不同，这主要是由各自的产业分布和发展特点及相应的政策不同决定的。台湾风险投资选择的行业以高科技产业为主，而大陆则围绕传统产业和新兴产业，两岸创投业的错位选择构成两岸风险投资合作的有利条件。
（三）投资阶段分布的差异。国际上通常将接受风险投资的企业划分为五个发展时期:种子期、创建期、扩张期、成熟期和重整期。通常投资于越早的时期，风险越大但回报率也越高。新世纪以来，大陆创业投资资本分布呈“中间大两头小”的特点。2010年大陆创业投资资本仍然集中在项目中后期，其中成长(扩张)阶段的比例达到49.2%，成熟阶段则占到了20.2%，对种子期和起步期的投资金额仅占27.6%。而在台湾地区，在总体分布上，投资于各个阶段的资本比例也是“中间大两头小”，而且其重点投资阶段一直都处于扩充期。因此，两岸的创业资本在投资阶段有着向中后期发展的趋势。
两岸创业投资的优势比较
台湾地区在人才方面有明显优势。伴随着台湾地区风险投资30年的发展，其专业人才储备丰富，不但熟悉国际资本市场，而且知晓产业发展新动向。在大陆，既熟悉国际资本市场和产业发展动向，又了解国内投资市场的创业投资人才屈指可数，供不应求，这导致专业投资经理流动过于频繁，从而引起创投公司之间的恶性竞争和投资团队的不确定性。
大陆则在市场方面拥有明显优势。大陆的科技成果和项目资源比较丰富。截至2010年底，中国创业风险投资机构累计投资8693项，其中投资于高新技术企业（项目）数达5160项。随着金融海啸的爆发和欧债危机的不断演变，大陆经济增长前景被普遍看好，加之政府提出“加强自主创新、建设创新型国家”的发展战略，大陆未来案源储量比较丰富。相形之下，台湾岛内电子、半导体等高科技产业日趋成熟，很难再发掘质量俱佳的风险投资产业。加之，资本市场低迷打击了投资者信心，岛内风险投资案源明显不足。1996~1999年台湾风险投资公司年均案例数为10.9件，2000~2006年为4.1件，2007~2010年仅为2.2件。
此外，政府部门在两岸创投业的发展中扮演不同角色。在大陆，长期以来，政府部门主导创投业的发展，即早期的创业投资机构大都是政府直接或间接投资的，具有很强的“财政”背景，这导致其缺乏约束和激励机制，资金使用效率低下，在一定程度上阻碍创投业的发展。随着宏观经济环境的不断改善、创业投资运行机制的逐步规范，政府的资金也逐渐剥离或淡出，并不断引导民间资本进入创业投资领域，实现创业投资资本的多元化。而台湾当局对创投业的发展则更多地采取引导的形式加以支持，通过制定完善的法律法规体系，营造良好的制度环境，引导其他各种形式的民间资本而不是由官方资本直接投入创投业，从而促进了创投业有序、快速发展，最主要的工具是是税收减免和资金融通。
正因为海峡两岸在发展阶段、资金来源、投资情形、退出机制和优势所在等方面的差异，海峡两岸创业投资的合作，有利于两岸创业投资拓宽资本来源，壮大资本实力；挖掘投资潜力，开拓投资市场；改善经营管理，优化投资效果；畅通退出渠道，实现投资目标。
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